2015年,印尼超级联赛发生了一些动荡,组织方为了应对印度尼西亚政府划定的足球改革计划而暂停了2015赛季。但在2016年,印尼足协决定重新开启印尼超级联赛,采用了新的比赛系统和规则。新赛季的印尼超级联赛于2016年4月开始,而且得到了新的赞助方和电视台的支持。
2016赛季印尼超级联赛的秋季联赛于4月15日开始,19支队伍被分为两个组,A组和B组,每个小组前4名进入季后赛。2017赛季,印尼超级联赛未能顺利进行,赛程被多次推迟,部分球队甚至被裁撤。
2018年,印尼超级联赛进行了一个调整,赛制从季赛改为单循环赛。12支球队在上半年进行比赛,前八名晋级季后赛,夺冠球队将代表印尼参加亚足联冠军联赛。2019年,印尼超级联赛又一次重启赛季,采用了和2018年类似的赛制。
印尼超级联赛曾经出现过一些具有国际影响力的球队,比如珀塔莱乌、阿连恒、伯罗加等。在历史上,阿连恒和珀塔莱乌曾六次夺得联赛冠军,是印尼职业联赛历史上的两个最成功球队。
在2018赛季的印尼超级联赛中,珀塔莱乌一度领先积分榜,但在赛季后阶段遭遇了一些困难,最终排名第三。拜仁慕尼黑青训营培养出了一位出色的球员菲利普-克洛斯,他的出色表现也使印尼超级联赛受到了更多的关注。
2019年,印尼超级联赛的比赛制度略微升级。球队首先在第一阶段进行短循环赛,之后再根据成绩分成三个组进行长循环赛。最终排名前四的球队晋级季后赛,决战夺冠。
目前,印尼超级联赛仍在持续进行中,越来越多的印尼球迷和足球爱好者开始关注这个国内最高水平的足球联赛。虽然受到政治、经济、商业等因素影响,印尼超级联赛的发展曲折莫测,但是每一年参加这个联赛的球员、教练和球迷都在努力打造印尼足球的明天。